LBP (protein liên kết với lipopolysacarit) là một glycoprotein có trọng lượng phân tử tương đối là 60000. Cấu trúc protein của nó là một polypeptide chuỗi đơn có trọng lượng phân tử tương đối là 5000. Nó trải qua phản ứng glycosyl hóa trong cơ thể Golgi và bài tiết vào máu sau khi trưởng thành để trở thành một glycoprotein. LBP không chịu nhiệt và hoạt động của nó thường ổn định ở 50oC và khoảng 50% hoạt động của nó bị mất trong khoảng từ 53 đến 56oC. Khi huyết thanh chuột hoặc LBP tinh khiết của chuột được làm nóng đến 59 ℃, hoạt tính này bị mất hoàn toàn. Huyết tương của con người rất nhạy cảm với nhiệt. Phương pháp khử hoạt tính bổ sung phổ biến nhất (56 ℃, 30 phút) có thể dẫn đến mất 70% hoạt tính sinh học của LBP.

Hiện tại, người ta đã làm rõ rằng trình tự axit amin của protein LBP của con người là một chuỗi polypeptide protein trưởng thành bao gồm một peptide trình tự tín hiệu với 25 gốc axit amin và 452 gốc axit amin. Có bốn cystein và năm vị trí liên kết glycosyl hóa trên chuỗi polypeptit, nằm ở các vị trí 275~277, 325~327, 330~332361~363 và 369~371 của chuỗi polypeptit tương ứng. Cấu trúc protein của LBP thỏ rất giống với cấu trúc của con người. Nó cũng bao gồm một chuỗi polypeptide kỵ nước bao gồm 26 gốc axit amin và một chuỗi polypeptide protein bao gồm 456 gốc axit amin. Trình tự axit amin của nó rất tương đồng với trình tự của con người, với 69% trình tự axit amin giống nhau; Trình tự nucleotide nhất quán 78%, nhưng chỉ chứa 2 cystein và 3 vị trí liên kết glycosyl hóa, nằm ở các vị trí 275~277, 325~327 và 361~363 tương ứng. Cấu trúc không gian hóa học của LBP vẫn chưa rõ ràng, có thể tương tự như BPI (protein diệt khuẩn/tăng cường tính thấm).