Chuỗi polysaccharid của kháng nguyên O kết nối với vùng lõi của lipid A ở bề mặt chu chất của màng tế bào để tạo thành một phân tử lipopolysaccharid hoàn chỉnh. Việc chuyển các phân tử lipopolysacarit từ không gian periplasmic sang màng ngoài, nhưng cơ chế trình bày của nó ở màng ngoài vẫn chưa rõ ràng. Người ta suy đoán rằng nó có thể đạt được thông qua "cầu Bayer" tại các vị trí gắn kết của màng trong và màng ngoài.

Waal (Rfal) là enzyme duy nhất được biết là có liên quan đến phản ứng liên kết. Waal có thể kết nối hiệu quả các polyme có trọng lượng phân tử tương đối lớn hoặc oligome có trọng lượng phân tử tương đối nhỏ với vùng lõi của lipid A. Đặc điểm cơ bản của phản ứng liên kết là nó bảo thủ và không phụ thuộc vào con đường tổng hợp kháng nguyên O. Kháng nguyên O được tổng hợp bởi các vi khuẩn khác nhau thông qua các con đường khác nhau có thể được kết nối và biểu hiện hiệu quả trên bề mặt tế bào, đây cũng là cơ sở để nghiên cứu và biểu hiện kháng nguyên O dị loại của chủng Escherichia coli K-12 bằng kỹ thuật di truyền.

Cấu trúc chính của Escherichia coli K-12 và Salmonella typhimurium Waal không có sự tương đồng rõ ràng. Mặc dù cả hai đều chứa nhiều miền xuyên màng, cấu hình kỵ nước của chúng rõ ràng là giống nhau, nhưng chức năng của chúng không thể giống nhau. Hoạt động hiệu quả của từng enzyme Waal có thể yêu cầu sự phối hợp của Waak (tức là Rfak), cho thấy rằng việc sửa đổi cấu trúc lõi cụ thể hoặc (và) sự tương tác cụ thể giữa Waal và protein Waak có thể cần thiết cho hoạt động của từng enzyme Waal. Trên bề mặt tế bào, kháng nguyên O chỉ có thể tồn tại theo cách liên kết với lõi lipid A (như Salmonella typhimurium), hoặc theo cách liên kết có hoặc không có lõi lipid A. Loại thứ hai được đại diện bởi kháng nguyên O của Vibrio cholerae O139. Chỉ có một oligosacarit ngắn (đơn vị lặp lại đơn) được kết nối với lõi và polysacarit dạng nang có trọng lượng phân tử tương đối lớn (không được kết nối với lõi) chứa cấu trúc đơn vị lặp lại giống nhau.